برای درمان مقعد ابتدا باید دقیقاً بدانید درگیر کدام  بیماری مقعد هستید؛ ما پیشنهاد می‌کنیم تشخیص دقیق را به ویزیت دکتر موکول نمایید تا تمام جزییات مورد بررسی قرار بگیرد. پزشک معالج برای درمان مقعد ابتدا وخامت بیماری را بررسی میکند سپس منشا ایجاد آن را مورد ارزیابی قرار می دهد و اگر مقدور باشد درمان مقعد را با دارو پیش می‌برد. عمل و تخلیه آبسه مقعد ضروری است. منتهی شقاق ، بواسیر و حتی فیستول را می تواند با اصلاح رژیم غذایی و مصرف دارو بهبود داد ؛ البته باید بدانید درمان مقعد با دارو فقط در مراحل ابتدایی بیماری ثمر بخش است. اگر قرار باشد این درمان با عمل جراحی انجام شود برای کاهش نقاهت و کمتر بودن درد بیماران بهتر است برای درمان مقعد از دستگاهی بنام لیزر co2 استفاده شود. عملکرد این دستگاه به نوعی است که محل زخم و تورم را مورد تهاجم متمرکز قرار می‌دهد و بافتهای آسیب دیده را بر می‌دارد تا سلولها بتوانند به ترمیم محل زخم بپردازند. در مورد عمل آبسه مقعد ؛ لیزر می‌تواند محل جمع شدن عفونت را به شکل بسیار دقیقی بشکافد تا پزشک متخصص، بتواند با کمترین آسیب رساندن به محل تورم و جمع شدن عفونت بیمار را درمان کند. درمان مقعد با لیزر co2 برای بیمار بسیار راحت است و نیازی به بستری شبانه و بیهوشی نیست، نقاهت بسیار کوتاه مدت است و مدت زمان عمل جراحی حدوداً 15 دقیقه می‌باشد.